fMRI how-to

Installazione del software FSL

Il software di post-elaborazione FSL può essere installato efficacemente – in particolare su sistemi Debian e Ubuntu Linux – tramite la Debian Neuroscience Repository. E’ consigliato il mirror USA-NH (Dartmouth College) che contiene un maggior numero di pacchetti ed effettuare la scelta “all software”.
Dopo l’esecuzione delle istruzioni per aggiungere la repository al sistema operativo, si installa il pacchetto completo di fsl digitando in un terminale il comando:
sudo apt-get install fsl-complete

Verifica e prestazioni del sistema

E’ consigliabile installare anche il set di dati  FEEDS – FSL Evaluation and Example Data Suite che permette di valutare il funzionamento e le prestazioni del software installato:
sudo apt-get install fsl-feeds

FEEDS si esegue con:
cd /usr/share/fsl-feeds/
fsl-selftest

Le prestazioni del proprio sistema possono essere valutate confrontandole con i TimingResults di altri sistemi.
Su Dell Latitude E6320 con Xubuntu 14.04 e FSL 5.0.9 il test FEEDS 5.0.4 viene eseguito in circa 25 minuti (1500 secondi).